Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgm3Q08189 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms