Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms