Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPCQ01831 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XPCQ01831 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
XPCQ01831 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms