Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb2Q00977 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms