Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms