Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Traf6P70196 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms