Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tuba4aP68368 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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