Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccna2P51943 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms