Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TAF1P21675 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1P21675 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1P21675 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms