Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VimP20152 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VimP20152 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VimP20152 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms