Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmga1P17095 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmga1P17095 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmga1P17095 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms