Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PolP11369 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolP11369 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolP11369 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolP11369 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms