Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNB1P11230 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNB1P11230 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms