Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Grpel2O88396 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grpel2O88396 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Grpel2O88396 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grpel2O88396 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grpel2O88396 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grpel2O88396 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms