Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnnal1O88327 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms