Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms