Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc27a2O35488 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc27a2O35488 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms