Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Kpna6O35345 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Kpna6O35345 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Kpna6O35345 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Kpna6O35345 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Kpna6O35345 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Kpna6O35345 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms