Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrg3O35181 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrg3O35181 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrg3O35181 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrg3O35181 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrg3O35181 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms