Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm5458L7N219 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5458L7N219 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms