Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3248K7N721 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms