Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf212F6TQD1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf212F6TQD1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf212F6TQD1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rnf212F6TQD1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf212F6TQD1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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