Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim30bE9PVL6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms