Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc8D3YZV8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc8D3YZV8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms