Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms