Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scnn1gQ9WU39 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scnn1gQ9WU39 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms