Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms