Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rexo2Q9D8S4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms