Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cldn22Q9D7U6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cldn22Q9D7U6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn22Q9D7U6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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