Protein–RNA interactions for Protein: Q9D443

4933415A04Rik, RIKEN cDNA 4933415A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933415A04RikQ9D443 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
4933415A04RikQ9D443 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms