Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Upk1aQ9D132 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Upk1aQ9D132 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Upk1aQ9D132 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1aQ9D132 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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