Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SdhdQ9CXV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms