Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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