Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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