Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrp1bQ91YK2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrp1bQ91YK2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms