Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cacng8Q8VHW2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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