Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxc12Q8K5B8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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