Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Abcf3Q8K268 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcf3Q8K268 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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