Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc85bQ6PDY0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms