Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt39Q6IFX4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms