Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3bQ62141 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms