Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Syne3Q4FZC9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syne3Q4FZC9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms