Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd2Q149F1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd2Q149F1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms