Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACSM1Q08AH1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms