Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NrepQ07475 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms