Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcn1Q05186 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcn1Q05186 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms