Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pax8Q00288 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms