Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nbr1P97432 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms