Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsnl1P62761 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms