Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms